¿Por qué son importantes las directrices internacionales para las pruebas del microbioma intestinal en la práctica clínica?

El 5 de diciembre de 2024, un grupo internacional de científicos en microbiología publicó su declaración de consenso internacional sobre las pruebas del microbioma en la práctica clínica en The Lancet (). Este documento tenía como objetivo brindar pautas internacionales sobre las buenas prácticas de prueba del microbioma intestinal para su uso en la práctica clínica. Si bien la evidencia científica continúa aumentando sobre la gran importancia de los microorganismos en el microbioma intestinal y su relación con muchos aspectos de la salud humana, los expertos creen que la tecnología del microbioma intestinal se utilizará cada vez más en la práctica clínica. Por lo tanto, es importante establecer pautas internacionales para el uso de las pruebas del microbioma intestinal en la práctica clínica.

¿Cómo se compara la prueba InnerBuddies con estas pautas internacionales?

InnerBuddies es una empresa impulsada por la ciencia y somos una filial de la Universidad de Maastricht. Eso significa que siempre nos centramos en asegurarnos de que nuestros productos estén actualizados con los últimos conocimientos y avances científicos. Por eso, obviamente, estábamos ansiosos por comprobar que nuestro producto existente se ajustaba a las directrices internacionales establecidas por un grupo internacional de expertos.

Las directrices internacionales constan de 35 afirmaciones diferentes divididas en cinco grupos de trabajo diferentes. A continuación, repasaremos las 35 afirmaciones diferentes y explicaremos cómo la tecnología InnerBuddies coincide con todas ellas.

Como puede ver a continuación, InnerBuddies cumple totalmente con 32 de las 35 pautas y cumple parcialmente con las 3 pautas restantes.

Grupo de trabajo 1: principios generales y requisitos mínimos para la realización de pruebas de microbioma

Este grupo de trabajo se centró en los principios generales y algunos requisitos mínimos para las pruebas del microbioma.

Declaración 1: Los proveedores de pruebas de microbioma deben comunicar una representación razonable, confiable, transparente y científica de la prueba, haciendo que los clientes sean claramente conscientes de la escasa evidencia de su aplicabilidad en la práctica clínica.

InnerBuddies se centra en:

• Incluir únicamente en su panel de control e informes funciones para las que consideremos que hay suficiente evidencia científica. Todas las funciones que se lancen en nuestra plataforma deben contar con la aprobación de Koen Venema, un reconocido experto internacional en microbiología con más de 30 años de experiencia en la Universidad de Wageningen, la Universidad de Maastricht y TNO.
• Traducir el lenguaje científico a un lenguaje que sea comprensible para el consumidor habitual. Ésta es precisamente la parte más difícil de nuestro trabajo: traducir todo este material científico a un lenguaje que los clientes puedan entender.
• Para que el análisis del microbioma intestinal se utilice correctamente en la práctica clínica, es necesario que se acerque más a las indicaciones médicas específicas. Sin embargo, por el momento, todavía hay evidencia (y precisión) limitadas para poder hacerlo. Por eso, el producto actual de InnerBuddies se centra en la población sana y en temas de salud general (y no en indicaciones médicas específicas).

Declaración 2: La realización de pruebas de microbioma implica un marco complejo, desde la recolección de muestras biológicas hasta la secuenciación del genoma microbiano y los análisis computacionales, y la publicación de un informe interpretable. Por lo tanto, los proveedores de pruebas de microbioma deben incluir expertos con competencias multidisciplinarias.

En realidad, aquí es donde el equipo de InnerBuddies tiene una propuesta única de venta (PVU) sólida, ya que nuestro equipo combina tres disciplinas diferentes:

• Microbiología, que se centra en el conocimiento y la experiencia en torno a las pruebas de laboratorio.
• Dietistas que se ocupan del conocimiento y la experiencia en torno a la alimentación, la nutrición y la salud, pero también de cómo presentar todo a los consumidores para que puedan entender lo que están haciendo y que el asesoramiento nutricional se presente de una manera práctica para los consumidores.
• Inteligencia artificial (IA), que en este caso trata de utilizar el Big Data de las pruebas de ADN en microbiología para descubrir toda la información incluida en las secuencias de ADN.

Declaración 3: Cualquier cambio en el manejo clínico de los pacientes basado en pruebas de microbioma debe ser realizado únicamente por sus médicos referentes o profesionales de la salud.

Para InnerBuddies, el uso clínico de las pruebas del microbioma intestinal se refiere al uso de pruebas del microbioma intestinal relacionadas con afecciones médicas específicas. Lo hemos traducido de las siguientes maneras:

• Separamos el "uso por parte de los consumidores" de las pruebas del microbioma intestinal del "uso por parte de los profesionales de la salud". Atendemos a ambos tipos de clientes, pero nuestra experiencia también nos ha enseñado que los consumidores requieren la información de una manera muy simple y práctica, mientras que los profesionales de la salud desean ver información más técnica. Por eso, crearemos un módulo de "información para expertos" independiente para los profesionales de la salud que incluye información técnica más detallada sobre la prueba del microbioma intestinal.
• En nuestro producto actual InnerBuddies no proporcionamos ninguna evaluación relacionada con la condición médica del microbioma intestinal ni asesoramiento relacionado con ninguna condición médica específica. Sin embargo, el equipo de InnerBuddies está en proceso de organizar ensayos clínicos independientes (con universidades) sobre condiciones médicas específicas donde el asesoramiento nutricional personalizado de InnerBuddies se adaptará a condiciones médicas específicas. Después de los ensayos clínicos positivos, esta funcionalidad está destinada a estar disponible en productos separados que estarán disponibles a través de reembolsos bajo la regulación de dispositivos médicos para estas condiciones médicas específicas.

Declaración 4: Los laboratorios que brindan pruebas del microbioma intestinal deben garantizar altos estándares de calidad y protección de los datos de los pacientes, y estar acreditados, registrados y regulados.

Cuando InnerBuddies empezó a funcionar, utilizamos el laboratorio de la Universidad de Maastricht. En la actualidad, utilizamos dos laboratorios externos diferentes para realizar las pruebas del microbioma intestinal. Ambos laboratorios tienen altos estándares de calidad y están acreditados y regulados. Con ambos laboratorios tenemos acuerdos de procesamiento en virtud del RGPD.

 

Declaración 5: Se requieren bases de datos y canales de software computacionales validados y actualizados destinados a delinear la taxonomía microbiana para proporcionar pruebas de microbioma.

Este es uno de los puntos fuertes del equipo de InnerBuddies, ya que contamos con una amplia experiencia en microbiología y en TIC e inteligencia artificial. Contamos con las siguientes herramientas:

• Con nuestros dos laboratorios externos existentes, utilizamos dos tecnologías de secuenciación de ADN diferentes para las pruebas del microbioma intestinal: Illumina MiSeq y Oxford Nanopore. Ambos secuenciadores de ADN se encuentran entre los más modernos en pruebas del microbioma intestinal. Illumina MiSeq permite una taxonomía microbiana precisa hasta el nivel de género, mientras que la secuenciación completa 16S de Oxford Nanopore permite una taxonomía microbiana precisa hasta el nivel de especie.
• Probamos varios procesos de cálculo diferentes para cada uno de estos secuenciadores de ADN con muestras simuladas para encontrar el mejor proceso de cálculo (la mayor precisión en términos de búsqueda de bacterias, pero también de búsqueda de la abundancia correcta de cada bacteria). Con base en estas comparaciones, podemos afirmar que tenemos los cálculos de taxonomía microbiana más precisos que están disponibles actualmente en el mercado.
• Utilizamos la base de datos SILVA para la taxonomía microbiana. Esta base de datos también es utilizada por científicos de todo el mundo, ya que actualmente es la mejor base de datos validada disponible para taxonomía microbiana.
• Realizamos pruebas en nuestros dos laboratorios externos con muestras simuladas para pasar al proceso de laboratorio más preciso para nuestras muestras. Por ejemplo, es muy importante aplicar procesos de laboratorio específicos para asegurarnos de que se detecten correctamente tanto las bacterias grampositivas como las gramnegativas.

Grupo de trabajo 2: pasos de procedimiento antes de la prueba

Este grupo de trabajo se centra en las mejores prácticas a aplicar antes de que se realice la prueba real del microbioma intestinal.

Declaración 6: Como hay poca evidencia de la aplicabilidad de las pruebas del microbioma intestinal en la práctica clínica, se desaconseja la solicitud directa por parte de los pacientes de pruebas del microbioma sin una recomendación clínica.

InnerBuddies reconoce que existen dos mercados para las pruebas del microbioma intestinal:

• Consumidores curiosos que desean realizar análisis de microbioma intestinal para ver cómo es su microbioma intestinal. Estos consumidores también desean asesoramiento nutricional personalizado, asesoramiento personalizado sobre diarios de alimentación y asesoramiento personalizado sobre probióticos y prebióticos. En general, estos consumidores forman parte de la población sana y están ansiosos por trabajar en su salud general preventiva.
• Pruebas a través de profesionales de la salud (práctica clínica). Por lo general, se trata de clientes con afecciones médicas específicas que buscan una solución a sus problemas. Por eso también hablan con profesionales de la salud (HCP, por sus siglas en inglés). Los HCP pueden decidir si una prueba de microbioma intestinal tiene sentido para ese paciente en particular.

InnerBuddies no comercializa su prueba del microbioma intestinal en función de las condiciones médicas, ya que, en este momento, todavía hay evidencia científica limitada para usar pruebas del microbioma intestinal para condiciones médicas específicas. Esta decisión queda en manos de los profesionales de la salud que pueden brindar recomendaciones clínicas a los pacientes.

Declaración 7: Antes de la prueba, se deben recopilar datos clínicos clave del paciente, incluidos aquellos que podrían influir en las características del microbioma intestinal; la información esencial que se debe capturar debe incluir al menos edad, sexo, IMC, hábitos alimentarios, estado de tabaquismo y alcoholismo, tiempo de tránsito intestinal, comorbilidades y medicamentos, e historial médico previo.

Todos los clientes de InnerBuddies deben completar una encuesta que incluye preguntas sobre todos estos temas. Incluimos las respuestas a todas estas preguntas también en la generación de consejos personalizados en términos de nutrición, diario de comidas o probióticos y prebióticos.

Declaración 8: Los pacientes no deben suspender su terapia ni cambiar su dieta habitual antes de la prueba, a menos que lo recomiende el médico remitente.

Esto es correcto, InnerBuddies no ofrece ninguna recomendación sobre la suspensión de terapias existentes. InnerBuddies tampoco recomienda cambiar la dieta antes de la prueba. Sí ofrecemos recomendaciones sobre dieta y nutrición después de realizar la prueba. Lo hacemos de varias maneras:

• InnerBuddies ofrece un diario de alimentación personalizado. Este se basa en el diario de alimentación de 3 días que los clientes completan más las respuestas a las preguntas de la encuesta (este consejo no se basa en la prueba del microbioma intestinal). Este producto genera un consejo fila por fila sobre el diario de alimentación de 3 días, similar al proceso normal de los dietistas. Dado que este consejo se basa en la dieta existente que sigue el cliente, resulta muy práctico y factible para que el cliente lo siga.
• Los consejos nutricionales personalizados de InnerBuddies se basan en el test del microbioma intestinal y en las respuestas a las preguntas de la encuesta. En este producto recomendamos alimentos específicos que se deben añadir a la dieta y alimentos específicos que se deben evitar.

Declaración 9: La recolección de muestras de heces debe evitar cualquier contaminación ambiental y garantizar la preservación del genoma.

InnerBuddies se centra en recolectar muestras de buena calidad y estabilidad. Para ello, hacemos dos cosas específicas:

• En nuestro kit de prueba físico hemos incluido todo tipo de materiales que ayudan al consumidor a recolectar fácilmente la muestra de heces en el inodoro. Esto incluye cinta de recolección que puede colocar en su inodoro y con la que puede atrapar fácilmente las heces para que no caigan al agua del inodoro.
• También contamos con un tubo que contiene un líquido tampón para que el material recolectado permanezca estable y no se pierda en el estante durante aproximadamente 2 años. InnerBuddies está trabajando junto con proveedores para desarrollar líquidos tampón que mantengan la muestra estable durante un período de tiempo más prolongado.

Declaración 10: Las muestras recolectadas deben enviarse a laboratorios de análisis con estándares de garantía para la secuenciación del microbioma dentro de los plazos y condiciones recomendados que se describen en las instrucciones de los kits de recolección. Una vez que llegan, las muestras deben almacenarse a -80 °C hasta su posterior procesamiento.

Nuestros dos laboratorios externos almacenan todas las muestras recibidas secas (a -80 grados Celsius) cuando llegan. Ambos laboratorios tienen estándares de garantía y están acreditados. Ambos laboratorios utilizan diferentes máquinas de secuenciación de ADN y sus plazos de procesamiento se ajustan a sus Acuerdos de Nivel de Servicio (SLA).

Declaración 11: El análisis del microbioma de muestras biológicas distintas de las heces, incluidos hisopos vaginales, cutáneos y orales, muestras de saliva y leche materna, debe procesarse de acuerdo con la evidencia científica existente y las indicaciones clínicas.

Actualmente InnerBuddies solo procesa muestras de heces (de heces) aunque estamos trabajando en propuestas multiómicas donde también procesamos otros tipos de muestras. En todos estos casos, por supuesto, trabajaremos de acuerdo con la evidencia científica existente y las indicaciones clínicas.

Grupo de trabajo 3: análisis del microbioma

Este grupo de trabajo se centró en el proceso y las técnicas de laboratorio reales y también en la parte de análisis del microbioma intestinal.

Declaración 12: Los métodos apropiados para la elaboración del perfil de la comunidad del microbioma intestinal incluyen la secuenciación de amplicones y la secuenciación del genoma completo.

InnerBuddies utiliza tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) y, específicamente, la secuenciación de amplicones de la región 16S. Para Illumina MiSeq nos centramos en la región 16S V3/4, mientras que para Oxford Nanopore nos centramos en la región Full16S. En este momento también estamos realizando algunos experimentos con secuenciación Shotgun (secuenciación del genoma completo).

Si bien los competidores a veces utilizan técnicas como qPCR, PCR o

Declaración 13: La PCR multiplex y los cultivos bacterianos, aunque son potencialmente útiles, no pueden considerarse pruebas del microbioma ni pueden utilizarse como sustitutos para la elaboración de perfiles del microbioma.

Consulte la afirmación 12 anterior. InnerBuddies no utiliza técnicas como PCR multiplex ni cultivos bacterianos. Utilizamos técnicas de secuenciación de amplicones más caras (y más precisas).

Declaración 14: El preprocesamiento de datos secuenciados sin procesar debe detallarse antes del análisis

De hecho, InnerBuddies realiza todo tipo de preprocesamiento y filtrado antes de realizar el análisis:

1. Quitar los primers
2. Filtrar secuencias de baja calidad
3. Filtrar secuencias demasiado cortas o demasiado largas
4. Realizar filtrado de quimeras
5. Etcétera

Declaración 15: El análisis del microbioma debe incluir métricas de diversidad alfa, incluidas la riqueza y la uniformidad.

De hecho, InnerBuddies proporciona métricas de diversidad alfa como el índice de Shannon, Pielou Eveness (uniformidad) y número de OTU (riqueza).

Las métricas de diversidad alfa son las métricas más importantes de la calidad del microbioma intestinal, ya que se han vinculado a muchas indicaciones de salud en la investigación científica.

Declaración 16: Las medidas de diversidad beta deben incluirse en el análisis del microbioma

InnerBuddies utiliza una cohorte sana, que es básicamente una forma de diversidad beta. Comparamos la abundancia de las 35 bacterias principales (nuestras bacterias clave) con los rangos saludables de la cohorte sana. Esto compara la calidad del microbioma intestinal con una cohorte de personas sanas conocidas y brinda orientación a las personas en las que la calidad de su microbioma intestinal podría mejorarse.

Declaración 17: Un perfil taxonómico completo de las comunidades microbianas intestinales es un componente esencial de las pruebas del microbioma.

InnerBuddies realiza un perfil taxonómico completo de las comunidades microbianas intestinales. Los clientes o los profesionales sanitarios pueden incluso descargar estos datos desde nuestro portal en formato CSV. Esto proporciona una transparencia total en el perfil taxonómico completo de la muestra de heces.

Declaración 18: Se debe incluir una comparación adecuada con un grupo de control sano emparejado en las pruebas del microbioma para ayudar a la interpretación del perfil taxonómico y de diversidad del paciente.

InnerBuddies combina el perfil taxonómico y de diversidad con una cohorte saludable. Al principio, InnerBuddies empezó con una cohorte saludable que heredamos de la Universidad de Maastricht. Sin embargo, después de un tiempo, InnerBuddies recopiló muchos más datos de clientes (con metadatos estructurados), por lo que ahora InnerBuddies puede actualizar periódicamente su cohorte saludable en función de su extensa base de datos.

InnerBuddies también está pasando a una cohorte sana para las vías bacterianas. Las vías bacterianas son más estables en todas las regiones y continentes e incluso proporcionarán una mejor base para la comparación de cohortes sanas. Esto es incluso más avanzado y actualizado que lo que sugieren los expertos en microbiología que participan en las directrices internacionales.

Declaración 19: Una evaluación longitudinal del microbioma del paciente en diferentes momentos podría ser útil en escenarios clínicos específicos

InnerBuddies permite a sus clientes (y profesionales de la salud) realizar múltiples pruebas, realizadas en diferentes momentos, y compararlas entre sí. InnerBuddies también ofrece suscripciones anuales que incluyen la realización de múltiples pruebas durante el año. Esto permite a los clientes seguir el progreso que han logrado mediante el seguimiento de nuestros diferentes tipos de asesoramiento personalizado.

La plataforma InnerBuddies contiene una amplia funcionalidad que permite una fácil comparación en detalle de estas diferentes pruebas.

Declaración 20: No se recomienda el análisis metabolómico de los fluidos biológicos en la práctica clínica. No se recomienda inferir el “potencial metabólico” del microbioma del paciente a partir de su perfil taxonómico.

La mayor parte de las investigaciones científicas realizadas en los últimos dos años sobre el microbioma intestinal humano se centran en las funciones metabolómicas de las bacterias, en lugar de centrarse únicamente en la población bacteriana. Diferentes bacterias pueden tener funciones biológicas similares. Esto se denomina "potencial metabólico" del microbioma intestinal, ya que al observar las vías metabólicas, se pueden observar básicamente las funciones biológicas que realizan las bacterias en el microbioma intestinal.

Existen diferentes bibliotecas tecnológicas que se pueden utilizar para calcular las vías metabólicas. InnerBuddies utiliza PictRust2, que es la biblioteca más respetada y la que se utiliza en la mayoría de los artículos de investigación científica. Existen dos tipos de secuenciación de ADN en los que se pueden utilizar estas bibliotecas:

• Secuenciación 16S (también llamada secuenciación de amplicones)
• Secuenciación de escopeta

A continuación encontrará una descripción general de estos dos tipos de secuenciación.

Actualmente, InnerBuddies utiliza la secuenciación del amplicón 16S en su producto. La razón es que este es el método más preciso para la elaboración de perfiles bacterianos. Para la elaboración de perfiles funcionales (predicción del potencial de la vía metabólica), la secuenciación shotgun es más precisa; sin embargo, este método es más del doble de caro que la secuenciación del amplicón 16S (lo que aumentaría el precio del producto InnerBuddies en un factor de 2).

InnerBuddies siempre se esfuerza por ofrecer la mejor relación calidad-costo para sus productos. Según investigaciones científicas, sabemos que el perfil funcional obtenido mediante la secuenciación del amplicón 16S alcanza aproximadamente el 90 % de la precisión obtenida con el perfil funcional obtenido mediante la secuenciación shotgun. Si bien para la práctica clínica, el precio real del producto de prueba puede ser menos relevante, para el uso del producto InnerBuddies por parte de los consumidores, el precio es muy relevante (ya que los clientes deben pagarlo ellos mismos).

Por lo tanto, desde una perspectiva científica, lo más preciso sería utilizar la secuenciación del amplicón 16S para el perfil bacteriano y la secuenciación shotgun para el perfil funcional. En total, esto aumentaría el precio del producto InnerBuddies en un factor 3. Por lo tanto, InnerBuddies ha optado por utilizar la secuenciación del amplicón 16S para ambos fines a fin de mantener el precio del producto a un nivel bajo. Dado que la precisión del perfil funcional es aproximadamente el 90 % de la precisión de la secuenciación shotgun, para InnerBuddies se trata de un compromiso aceptable.

Cuando el producto InnerBuddies se utilice en la práctica clínica (para indicaciones médicas específicas), esto podría llevarnos a incluir también la secuenciación shotgun dentro del producto. Dado que el producto de práctica clínica probablemente estaría cubierto por el reembolso de los seguros de salud, el equilibrio en términos de calidad versus costo sería diferente. Para fines de práctica clínica, probablemente favoreceríamos la secuenciación shotgun. Por cierto, InnerBuddies ya está utilizando la secuenciación shotgun para su negocio de microbioma del suelo InnerSoils.

Grupo de trabajo 4: características de los informes

Este grupo de trabajo se centró en las buenas prácticas en el área de visualización de resultados y consejos del análisis del microbioma.

Declaración 21: Los datos relativos a la historia clínica del paciente deben aparecer en el informe final

InnerBuddies muestra las respuestas al cuestionario de la encuesta como parte de su panel de clientes.

Declaración 22: El informe debe detallar brevemente el protocolo de prueba, incluidos los métodos de recolección y almacenamiento de heces, extracción de ADN, amplificación, secuenciación y análisis posteriores a la secuenciación.

Consideramos que este tipo de información pertenece a la propiedad intelectual (PI) de InnerBuddies. Se necesitó mucho tiempo, dinero y esfuerzo para lograr un flujo de trabajo de análisis del microbioma intestinal de alta calidad y estable.

Sin embargo, para fines de práctica clínica entendemos que este tipo de información es relevante para los profesionales de la salud. Una vez que lancemos nuestros productos de práctica clínica (con foco en condiciones médicas específicas), obviamente incluiremos este tipo de información.

Declaración 23: Las medidas de diversidad alfa y beta evaluadas en la fase de prueba deben incluirse en el informe final

InnerBuddies incluye ambos tipos de datos tanto en su panel de clientes como en sus informes en PDF.

Declaración 24: La composición del microbioma debe describirse con la resolución taxonómica más profunda posible.

InnerBuddies ofrece una resolución taxonómica a nivel de género para las pruebas de la región Illumina MiSeq 16S V3/4. No ofrecemos una resolución a nivel de especie para este análisis, ya que sabemos que no es lo suficientemente precisa (aunque vemos que la competencia la ofrece con este tipo de tecnología).

InnerBuddies proporciona una resolución taxonómica a nivel de especie para la prueba Oxford Nanopore Full16S. No proporcionamos una resolución a nivel de cepa para este análisis, ya que sabemos que no es lo suficientemente precisa.

Nuestros clientes pueden descargar el perfil taxonómico completo en formatos CSV y Excel desde nuestro panel de control para clientes. Esta es una función bastante exclusiva, ya que la mayoría de las empresas de análisis del microbioma intestinal no ofrecen esta opción.

Declaración 25: El informe debe incluir todos los taxones que se desvían significativamente de los controles sanos emparejados y los patógenos microbianos conocidos. El informe de taxones y grupos específicos relevantes para la salud, independientemente de su abundancia, podría ser de interés, a pesar de la escasa evidencia de una conexión causal con enfermedades humanas.

InnerBuddies incluye ambos aspectos en sus informes. InnerBuddies utiliza su top 35 de bacterias importantes (bacterias clave). Este top 35 se ha establecido como aquellas bacterias para las que la ciencia tiene más conocimiento disponible. InnerBuddies dividió estas bacterias en bacterias positivas, bacterias negativas y otras bacterias relevantes (la ciencia sabe que estas otras bacterias relevantes son importantes, pero la ciencia aún no está 100% segura de si estas bacterias son buenas o malas).

Se comparan las 35 bacterias principales en términos de abundancia con nuestra cohorte sana. Para cada bacteria de las 35 principales, incluimos información sobre el papel y la función de esa bacteria.

Declaración 26: No se recomienda informar la proporción Firmicutes-Bacteroidetes en las pruebas del microbioma.

Si bien muchas otras empresas de análisis del microbioma intestinal sí proporcionan esta proporción en sus informes, InnerBuddies ha decidido no hacerlo. Es una costumbre bastante antigua incluir esta proporción específica y la ciencia actualmente sabe que esta proporción no es realmente importante ni concluyente.

Declaración 27: No hay evidencia suficiente para incluir algún índice de disbiosis en el informe de las pruebas del microbioma, pero estas métricas justifican una mayor investigación.

De hecho, hemos visto que otras empresas de análisis del microbioma intestinal ofrecen cosas como "Índice de disbiosis" o "Índice de salud intestinal general", que básicamente intentan mostrar la salud intestinal en un número simple. Si bien muchos científicos están trabajando para tratar de encontrar un índice tan simple, actualmente no existe un método generalmente aceptado y correcto para mostrar la salud intestinal en un número simple. Por lo tanto, InnerBuddies ha decidido no incluir un número de este tipo en su panel de control de clientes o en sus informes en PDF todavía. Sin embargo, estamos trabajando con universidades en nuevas innovaciones que podrían hacer posible un número de salud intestinal tan simple.

Declaración 28: En general, no hay suficiente información para informar rangos de referencia saludables estrictos de abundancia relativa de especies.

Una de las mejores prácticas mencionadas anteriormente es utilizar una cohorte sana (diversidad beta) para comparar la composición del microbioma intestinal de la muestra de heces con la de la cohorte sana. InnerBuddies utiliza una cohorte sana que se define a nivel de "género", no a nivel de "especie". Y esto se debe exactamente a esta directriz, ya que no hay suficiente información para informar los niveles mínimos y máximos de una cohorte sana en función de los niveles de abundancia relativa de las especies.

Declaración 29: Se recomienda el uso de una infografía fácil de usar (por ejemplo, diagramas de barras o diagramas de cajas que muestren las abundancias relativas de los taxones clave) para que el informe sea fácilmente interpretable, mientras que se deben evitar las ordenaciones simples de taxones.

Desde su fundación en 2021, InnerBuddies ha dedicado mucho tiempo a pensar en la mejor manera de mostrar la información de las pruebas del microbioma intestinal a sus clientes mediante técnicas de visualización. De hecho, utilizamos visualizaciones infográficas para mostrar cómo se compara la abundancia de una bacteria en particular con los rangos saludables para esa bacteria.

Declaración 30: El panel desaconseja la notificación de cualquier consejo terapéutico posterior a la prueba por parte del proveedor de la prueba.

El panel de expertos ha indicado que aún no hay pruebas suficientes para poder ofrecer asesoramiento terapéutico posterior a la prueba basado en el análisis del microbioma intestinal. Sin embargo, InnerBuddies ofrece tres tipos de asesoramiento personalizado:

1. Asesoramiento nutricional personalizado
2. Asesoramiento personalizado sobre diario de alimentación
3. Asesoramiento personalizado sobre probióticos y prebióticos

Sin embargo, InnerBuddies ofrece estos productos de asesoramiento no solo en función de los resultados de la prueba del microbioma intestinal, sino también de las respuestas a la encuesta y al diario de alimentación de tres días que los clientes completan. En realidad, el asesoramiento personalizado del diario de alimentación se basa principalmente en el diario de alimentación de tres días y no en la prueba del microbioma intestinal. Además, el asesoramiento personalizado sobre probióticos y prebióticos se basa más en el cuestionario de la encuesta que en la prueba del microbioma intestinal. Hay una razón sencilla para esto:

• La mayoría de los probióticos han sido validados clínicamente en cuanto a funciones y grupos objetivo específicos. Esta información proviene del cuestionario de la encuesta y no de la prueba del microbioma intestinal.
• Muchas de las cepas bacterianas que han sido validadas clínicamente son las denominadas "cepas bacterianas sintéticas", lo que significa que han sido fabricadas en un laboratorio y no se encuentran de forma natural en el microbioma intestinal. Por lo tanto, una prueba del microbioma intestinal normalmente no podrá medir estas cepas bacterianas a menos que el cliente haya tomado recientemente esta cepa probiótica específica como parte de un suplemento alimenticio.

El asesoramiento nutricional personalizado de InnerBuddies se basa en una combinación de las tres fuentes de datos (cuestionario, diario de alimentación de tres días y prueba del microbioma intestinal), pero en lo que respecta a la parte del microbioma intestinal, se basa en gran medida en conjuntos de datos y algoritmos específicos que son propiedad de InnerBuddies. Estos no están disponibles para el ámbito científico. Sin embargo, InnerBuddies está trabajando junto con universidades para validar estos conjuntos de datos y algoritmos patentados en ensayos clínicos. Una vez que la investigación esté disponible en términos de publicaciones científicas, podrá encontrarlas en este sitio web. Pero convertir la prueba del microbioma intestinal en un asesoramiento nutricional personalizado es definitivamente de última generación e InnerBuddies es bastante único en este campo.

Declaración 31: Los datos sin procesar se pueden proporcionar al paciente si lo solicita (por ejemplo, para un análisis de segunda opinión) en forma de lecturas de amplicones o metagenómicas (según el método de secuenciación).

Sí, InnerBuddies permite a sus clientes descargar el perfil taxonómico completo desde su panel de clientes.

Grupo de trabajo 5: relevancia de las pruebas del microbioma en la práctica clínica: presente y futuro

Este grupo de trabajo se centró principalmente en el uso futuro de las pruebas del microbioma intestinal en la práctica clínica.

Declaración 32: No hay evidencia suficiente para recomendar ampliamente el uso rutinario de pruebas de microbioma en la práctica clínica, que debería estar respaldado por estudios específicos.

De hecho, actualmente, las pruebas del microbioma intestinal no se utilizan ampliamente en la práctica clínica. Sin embargo, dada la evidencia acumulada de la importancia de la salud del microbioma intestinal para la salud humana, los expertos esperan que las pruebas del microbioma intestinal se conviertan en algo tan normal como un análisis de sangre en la práctica clínica en los próximos 5 a 10 años. InnerBuddies quiere estar a la vanguardia de este desarrollo. Por lo tanto, InnerBuddies está trabajando activamente junto con universidades para probar su algoritmo de personalización en ensayos clínicos, dirigidos a condiciones médicas específicas.

Declaración 33: Los datos cualitativos o cuantitativos recuperables de los informes del microbioma podrían ser útiles en el manejo de varios trastornos, aunque todavía no hay evidencia suficiente para aplicarlos en la práctica clínica.

Así es. Sin embargo, hay varios proyectos de investigación que están explorando el uso en la práctica clínica de las pruebas del microbioma intestinal para afecciones médicas específicas. InnerBuddies, por ejemplo, participa en estudios sobre la obesidad, el síndrome del intestino irritable, el estrés y otras afecciones. Obviamente, estos productos solo se lanzarán al mercado después de que haya datos positivos de ensayos clínicos disponibles.

Declaración 34: Se necesitan estudios destinados a evaluar el valor del perfil del microbioma en diferentes trastornos para permitir que las pruebas se incorporen a la práctica clínica.

Sí, se están realizando muchos estudios para evaluar la precisión del uso de pruebas del microbioma intestinal para "probar" enfermedades específicas con la esperanza de que se puedan desarrollar pruebas que puedan brindar una alerta temprana sobre estas enfermedades.

Declaración 35: Se recomienda la divulgación de los posibles beneficios y desventajas de las pruebas del microbioma, y la capacitación sobre los conceptos básicos de la ciencia del microbioma y sobre la interpretación de los informes del microbioma, para fomentar y difundir su uso en la práctica clínica.

Sí, InnerBuddies está trabajando junto con profesionales de la salud para informarles sobre los beneficios de las pruebas del microbioma intestinal y lo que es científicamente posible en la actualidad. InnerBuddies seguirá haciéndolo una vez que haya más información científica disponible y este tipo de pruebas se utilicen más ampliamente en la práctica clínica.