InnerBuddies participant au projet néerlandais Holomicrobiome Groeifonds

Le projet Holomicrobiome Groeifonds représente une initiative importante du gouvernement néerlandais visant à faire progresser la recherche sur le microbiome et ses applications dans divers secteurs. En mars 2024, le cabinet néerlandais a alloué 200 millions d'euros du Fonds national de croissance pour établir un consortium public-privé dédié à l'étude des microbiomes et de leurs applications économiquement viables.

Objectif du projet Holomicrobiome Groeifonds

L'objectif principal du projet Holomicrobiome Groeifonds est de cartographier, d'analyser et de modéliser les relations entre les microbiomes des humains, des animaux, des sols, des plantes et de l'environnement. En intégrant la recherche sur le microbiome dans divers domaines scientifiques et secteurs d'activité, le projet vise à :

• : Développer des applications innovantes qui contribuent à la santé humaine, animale et environnementale, ainsi qu’à la durabilité.

• :Stimuler la croissance économique en créant de nouvelles opportunités dans des secteurs tels que l’agriculture, la santé et la gestion de l’environnement.

• :Approfondir la compréhension des microbiomes et de leurs interactions complexes au sein des écosystèmes.

Participants au projet Holomicrobiome Groeifonds

Le projet rassemble un consortium diversifié de participants, notamment :

Institutions académiques

Dix universités néerlandaises et cinq centres médicaux universitaires sont impliqués, apportant leur expertise en microbiologie, écologie, médecine et domaines connexes.

Le projet Holomicrobiome Groeifonds est une initiative collaborative impliquant dix universités néerlandaises et cinq centres médicaux universitaires. Les universités participantes sont :

1. Université d'Amsterdam (UvA)
2. Université Vrije d'Amsterdam (VU)
3. Université Radboud (RU)
4. Université de Groningue (RUG)
5. Université de technologie de Delft (TUD)
6. Université d'Utrecht (UU)
7. Université de Maastricht (UM)
8. Université de Twente (UT)
9. Université de Leyde (UL)
10. Université et recherche de Wageningen (WUR)

Les cinq centres médicaux universitaires concernés sont :

1. Église méthodiste unifiée d'Amsterdam
2. Centre Médical Érasme (CME Érasme)
3. Centre médical universitaire de Leyde (LUMC)
4. Centre médical universitaire Radboud (Radboud UMC)
5. Centre médical universitaire de Groningue (UMCG)

Ces institutions collaborent pour faire progresser la recherche sur le microbiome et ses applications dans divers secteurs.

Organismes de recherche

Les organismes de recherche impliqués dans le projet Holomicrobiome Groeifonds sont les suivants :

1. :Cet institut se concentre sur la recherche écologique, en particulier sur les interactions entre les micro-organismes et leurs environnements.

2. :KWR se spécialise dans la recherche sur le microbiome lié à l’eau, y compris l’étude des microbiomes dans les systèmes hydriques et leur rôle dans la qualité et la durabilité de l’eau.

3. :Cette branche de l'Université et de la Recherche de Wageningen est engagée dans la recherche sur les microbiomes des plantes et des animaux, en mettant l'accent sur l'agriculture et la durabilité.

Ces instituts de recherche, aux côtés des institutions universitaires et des participants du secteur privé, travaillent ensemble pour explorer et faire progresser la science du microbiome dans divers domaines, notamment la santé, l’agriculture et la durabilité environnementale.

Partenaires du secteur privé

De nombreuses entreprises, des start-ups aux grandes entreprises, collaborent pour traduire les résultats de la recherche en applications pratiques. Le projet Holomicrobiome Groeifonds rassemble plusieurs entreprises du secteur privé qui jouent un rôle clé dans la traduction des résultats de la recherche en applications concrètes. Ces entreprises couvrent une variété de secteurs, notamment l'agriculture, la santé, la biotechnologie et la durabilité environnementale.

Parmi les participants du secteur privé, on trouve :

1. DSM
2. Danone
3. Aliments Arla
4. Les copains de l'intérieur
5. Genzaï

Ces entreprises, ainsi que d’autres, contribuent au développement commercial de nouveaux produits, services et solutions basés sur la recherche sur le microbiome, qui ont le potentiel de révolutionner de nombreux secteurs.

Organismes gouvernementaux

Le ministère de l’Agriculture, de la Nature et de la Qualité alimentaire (LNV) dirige l’initiative, en coordonnant les efforts entre les différentes parties prenantes.

Plusieurs entités gouvernementales participent au projet, supervisent et coordonnent sa mise en œuvre et veillent à ce que le projet soit conforme aux objectifs nationaux de recherche et d'économie. Les principaux participants gouvernementaux sont les suivants :

1. :Ce ministère joue un rôle central dans la coordination du projet et son alignement sur les objectifs des Pays-Bas en matière d'agriculture durable, de qualité alimentaire et de santé environnementale. Le LNV est fortement investi dans le potentiel de la recherche sur le microbiome pour améliorer les pratiques agricoles et promouvoir la durabilité.
2. :Ce ministère intervient par le biais de ses initiatives en matière de soins de santé et de santé publique, notamment dans la manière dont la science du microbiome peut améliorer les résultats en matière de santé et aider à relever des défis tels que les maladies chroniques, la résistance aux antibiotiques et le développement de nouveaux traitements médicaux.

Ces entités gouvernementales travaillent ensemble pour fournir une supervision stratégique, un financement et des conseils afin d’assurer le succès du projet Holomicrobiome Groeifonds, en mettant l’accent sur les résultats scientifiques et sociétaux.

Quels sont les principaux sujets inconnus sur lesquels l’Institut Holomicrobiome souhaite mener des recherches ?

L'Institut, qui est au cœur du projet, vise à aborder plusieurs inconnues scientifiques clés concernant le microbiome et ses interactions avec les systèmes humains, animaux, végétaux et environnementaux. L'institut se concentrera sur l'élargissement des connaissances dans des domaines susceptibles de transformer des secteurs tels que la santé, l'agriculture et la durabilité. Certains des principaux sujets inconnus sur lesquels l'institut vise à faire des recherches comprennent :

1.

L’une des plus grandes inconnues concerne la manière dont les microbiomes des humains, des animaux, des plantes et de l’environnement interagissent entre eux. Bien que l’on sache que les microbiomes jouent un rôle crucial dans les écosystèmes individuels, l’interdépendance entre les différents microbiomes et leur impact collectif sur la santé et l’environnement restent mal compris. Les principales questions de recherche sont les suivantes :

• Comment les microbiomes de différentes espèces (humaines, animales, végétales) communiquent-ils et s’influencent-ils les uns les autres ?
• Quel est le rôle des microbiomes environnementaux (sol, eau, air) dans le soutien ou la perturbation d’autres microbiomes ?

2.

Le potentiel du microbiome dans la prévention ou la gestion des maladies est un domaine de recherche en plein essor. Cependant, de nombreuses questions demeurent quant aux mécanismes précis par lesquels les microbiomes influencent la santé humaine et animale. Les principales inconnues dans ce domaine sont les suivantes :

• Quelles espèces microbiennes ou compositions communautaires spécifiques protègent contre les maladies chroniques (par exemple, l’obésité, le diabète, les maladies cardiovasculaires) ?
• Comment les interventions sur le microbiome (par exemple, les probiotiques, les prébiotiques, les transplantations fécales) peuvent-elles être optimisées pour traiter ou prévenir les maladies ?
• Quel rôle jouent les microbiomes dans l’apparition de maladies auto-immunes, d’allergies et de maladies inflammatoires ?

3.

La résistance aux antibiotiques est un défi mondial urgent, et les microbiomes jouent un rôle essentiel dans le développement et la propagation de la résistance. Cependant, on ne comprend toujours pas clairement comment les microbiomes contribuent aux mécanismes de résistance et comment ils peuvent être modulés pour réduire la résistance. Les principales questions de recherche sont les suivantes :

• Comment les microbiomes contribuent-ils au développement de pathogènes résistants aux antibiotiques ?
• Pouvons-nous utiliser des thérapies basées sur le microbiome pour réduire ou inverser la résistance aux antibiotiques ?
• Comment les interventions sur le microbiome peuvent-elles aider à atténuer l’impact de la surutilisation ou de la mauvaise utilisation des antibiotiques ?

4.

L’agriculture et la durabilité environnementale pourraient grandement bénéficier d’une meilleure compréhension des microbiomes. L’institut se concentrera sur la manière dont les microbiomes peuvent être exploités pour améliorer la santé des sols, le rendement des cultures et les pratiques agricoles durables. Les principales inconnues dans ce domaine comprennent :

• Comment les microbiomes peuvent-ils être optimisés pour améliorer la croissance des plantes et augmenter la résilience des cultures aux ravageurs, aux maladies et au stress environnemental ?
• Quel est le rôle des microbiomes du sol dans la séquestration du carbone et l’atténuation des effets du changement climatique ?
• Comment les microbiomes du bétail peuvent-ils être gérés pour améliorer la santé animale, la productivité et la durabilité des systèmes agricoles ?

5.

Le rôle des microbiomes dans l’environnement, notamment dans des domaines tels que les systèmes d’eau, la qualité de l’air et la gestion des déchets, reste un sujet largement inexploré. L’institut vise à étudier la manière dont les microbiomes interagissent avec les facteurs environnementaux et contribuent à la santé globale des écosystèmes. Voici quelques questions clés :

• Comment les microbiomes des environnements naturels et urbains influencent-ils les niveaux de pollution, la biodiversité et les services écosystémiques ?
• Quel est le rôle des microbiomes dans la dégradation des polluants et des toxines dans le sol, l’eau et l’air ?
• Comment pouvons-nous utiliser la science du microbiome pour développer des solutions durables pour la gestion des déchets et le recyclage des ressources ?

6.

Les microbiomes varient considérablement d'un individu à l'autre, et la compréhension du rôle des microbiomes individuels dans la santé et la maladie est un domaine de recherche essentiel. L'institut étudiera comment des approches personnalisées peuvent être développées en fonction des profils de microbiomes pour améliorer les résultats des soins de santé. Les principales inconnues comprennent :

• Comment pouvons-nous développer des traitements ou des interventions personnalisés basés sur le microbiome pour différents individus ou populations ?
• Quels sont les effets à long terme des thérapies personnalisées du microbiome sur les résultats de santé et comment peuvent-ils être optimisés ?
• Comment pouvons-nous surveiller et suivre les changements dans le microbiome d’un individu au fil du temps pour adapter efficacement les interventions ?

7.

Le potentiel des microbiomes pour stimuler les innovations biotechnologiques est vaste mais largement inexploité. L'Institut Holomicrobiome étudiera comment les microbiomes peuvent être utilisés dans le développement de biotechnologies durables. Cela comprend :

• Comment les microbiomes peuvent-ils être exploités pour produire des biocarburants durables, des plastiques biodégradables ou d’autres bioproduits précieux ?
• Quelles sont les applications potentielles des microbiomes dans les bioprocédés industriels, tels que le traitement des déchets ou la capture du carbone ?
• Comment les biotechnologies basées sur le microbiome peuvent-elles contribuer aux modèles d’économie circulaire, où les déchets sont minimisés et les ressources réutilisées ?

8.

L’intérêt pour l’utilisation des microbiomes comme outils de diagnostic pour surveiller et prédire les problèmes de santé ne cesse de croître. Cependant, la compréhension des signatures microbiennes spécifiques associées aux maladies reste un domaine de recherche actif. L’institut explorera :

• Les profils du microbiome peuvent-ils être utilisés pour prédire la maladie avant l’apparition des symptômes, permettant ainsi une intervention plus précoce ?
• Quels sont les biomarqueurs du microbiome les plus fiables pour diagnostiquer des maladies ou des affections spécifiques ?
• Comment les diagnostics basés sur le microbiome peuvent-ils être intégrés à la pratique clinique pour une médecine personnalisée plus efficace ?

9.

Le rôle du microbiome dans le vieillissement et les maladies liées à l'âge est un domaine d'intérêt en plein essor. Cependant, de nombreuses questions restent sans réponse sur la façon dont les microbiomes évoluent avec l'âge et sur leur potentiel à influencer les processus de vieillissement. Les principaux sujets de recherche comprennent :

• Comment les microbiomes évoluent-ils au cours de la vie d’un individu et comment ces changements affectent-ils le vieillissement et les maladies liées à l’âge ?
• Les interventions sur le microbiome peuvent-elles aider à ralentir le processus de vieillissement ou à retarder l’apparition de maladies liées à l’âge comme le déclin cognitif ou la fragilité ?

10.

À mesure que la science du microbiome progresse, des défis éthiques et réglementaires importants sont associés aux thérapies et interventions basées sur le microbiome. L'Institut Holomicrobiome explorera également les implications sociales, éthiques et réglementaires de la recherche sur le microbiome :

• Quelles considérations éthiques découlent de l’utilisation des microbiomes dans la santé humaine, l’agriculture et la gestion de l’environnement ?
• Comment pouvons-nous élaborer des réglementations pour garantir que les interventions basées sur le microbiome soient sûres, efficaces et équitables ?
• Quels sont les risques potentiels et les conséquences imprévues de la manipulation des microbiomes, et comment peuvent-ils être atténués ?

En résumé, l'institut cherche à aborder un large éventail d'inconnues dans la science du microbiome, depuis la compréhension fondamentale des interactions du microbiome à travers les écosystèmes jusqu'à l'application pratique de solutions basées sur le microbiome dans les domaines de la santé, de l'agriculture et de la durabilité environnementale. En explorant ces inconnues, l'institut vise à libérer tout le potentiel des microbiomes pour le bénéfice de la société.

Quel est le rôle d’InnerBuddies dans le projet Holomicrobiome ?

InnerBuddies, une entreprise spécialisée dans les solutions personnalisées de santé intestinale, participe activement au projet. Son rôle consiste à intégrer son expertise en analyse du microbiome intestinal aux objectifs de recherche plus larges de l'institut.

InnerBuddies travaille également sur un projet dérivé axé sur les sols agricoles appelé InnerSoils. Étant donné que le programme Holomicrobiome couvre tous les types de microbiome (y compris le microbiome du sol), il existe également un lien vers InnerBuddies.