Sur Internet, vous pouvez trouver de nombreux sites proposant des tests de microbiote intestinal. Mais qu'est-ce qui distingue réellement le produit d'InnerBuddies de tous ces autres tests ? Voici un aperçu des nombreux aspects dans lesquels nous pensons être uniques.

10 raisons pour lesquelles notre test du microbiome intestinal est de premier ordre

1 - Tampon liquide spécial pour maintenir l'échantillon de selles stable

Lorsque vous recevez notre kit de test à domicile, il contient toutes sortes de matériaux pour faciliter le prélèvement d'un échantillon de selles sur les toilettes. Il comprend également un tube de prélèvement contenant un liquide tampon. Vous êtes censé y mettre l'échantillon de selles. Le liquide tampon garantit que votre échantillon de selles reste stable pendant 1 à 2 ans. Nous utilisons le meilleur liquide tampon (qui est également assez cher en termes de coût) afin de pouvoir être sûrs que la qualité de votre échantillon de selles reste stable. En fait, notre équipe travaille avec des fournisseurs de liquide tampon pour fabriquer des versions encore meilleures.

2 - Innovations dans le séquençage de nouvelle génération (NGS)

Il existe toutes sortes de fournisseurs d'équipements de séquençage d'ADN. Mais tous les équipements d'ADN ne sont pas identiques et les résultats d'analyse d'ADN varient en précision selon le type d'équipement d'ADN. L'équipe d'InnerBuddies, en raison de sa formation scientifique, met l'accent sur la meilleure qualité. Cela se reflète dans un certain nombre d'aspects :

• Nous testons régulièrement tous nos laboratoires externes avec des « échantillons blancs » de haute qualité. Les échantillons blancs sont des échantillons dont nous savons exactement quelles bactéries ils contiennent et en quelle quantité. Cela nous permet de vérifier si la qualité de sortie de l'équipement ADN correspond à la composition réelle des échantillons blancs.
• Nous utilisons ce que l'on appelle le séquençage de nouvelle génération (NGS). Il s'agit d'une technique plus coûteuse et plus avancée que la PCR, la qPCR ou l'ELISA utilisée par de nombreux autres fournisseurs de tests de flore intestinale. Par conséquent, nous trouvons TOUTES les bactéries dans votre test de microbiome intestinal, ces autres techniques ne trouvent qu'un ensemble limité de bactéries prédéterminées. Dans notre tableau de bord, vous pouvez donc télécharger une liste de toutes les bactéries trouvées.
• Nous travaillons en étroite collaboration avec des acteurs innovants afin d'obtenir une qualité de production d'ADN de très haut niveau. Par exemple, nous collaborons avec Illumina et Oxford Nanopore dans le domaine du séquençage de l'ADN, ainsi qu'avec des acteurs qui fournissent les matériaux de haute qualité nécessaires à la réalisation de cette analyse.

3 - Techniques spéciales en laboratoire

Chaque bactérie est unique. Par exemple, il existe des bactéries Gram-négatives et des bactéries Gram-positives. Les bactéries Gram-positives sont bleues ou violettes après coloration de Gram lors d'un test de laboratoire. Elles ont des parois cellulaires épaisses. Les bactéries Gram-négatives sont roses ou rouges lorsqu'elles sont colorées et ont des parois cellulaires fines. Comme les bactéries Gram-positives ont des parois cellulaires plus épaisses que les bactéries Gram-négatives, il est plus difficile de les distinguer correctement. Sans techniques spéciales, on verrait très bien les bactéries Gram-négatives, tandis que les bactéries Gram-positives sont assez peu visibles. Mais cela ne signifie évidemment pas qu'elles n'existent pas. En bref, nous utilisons des techniques spéciales pour nous assurer de pouvoir distinguer et compter correctement les bactéries Gram-positives et Gram-négatives.

4 - Pipeline de calcul propriétaire basé sur l'IA

Le résultat d’un séquençage d’ADN est une grande collection de séquences d’ADN. Chaque séquence d’ADN n’est rien d’autre qu’une suite de lettres (qui représentent les différents acides aminés). C’est alors que le travail commence réellement. Sur la base de ces séquences, nous devons découvrir exactement quelles bactéries sont impliquées ou quelles fonctions bactériennes sont contenues dans cette séquence. Pour ce faire, nous utilisons toutes sortes de techniques d’IA complexes qui, en se basant sur la reconnaissance de formes et la mise en correspondance avec de grandes bases de données de séquences connues, tentent de découvrir exactement quelles bactéries sont impliquées ou quelles fonctions bactériennes sont contenues dans ces séquences. InnerBuddies a construit et entraîné ses propres modèles d’IA à cet effet, qui utilisent une technique similaire à celle utilisée par OpenAI avec ChatGPT.

5 - Calcul des bactéries ainsi que des fonctions bactériennes

La plupart des prestataires de tests de la flore intestinale ne prennent en compte que la population bactérienne présente dans l'échantillon de microbiome intestinal. Cependant, les populations d'Asie ont une population bactérienne intestinale complètement différente de celle des Européens. Même selon les pays, cela varie. En effet, les personnes de différents pays suivent un régime alimentaire très différent, car les habitudes alimentaires et la culture sont très différentes d'un pays à l'autre.

InnerBuddies effectue donc un autre calcul beaucoup plus complexe, à savoir : nous identifions les fonctions bactériennes. Ces fonctions bactériennes sont indispensables au corps humain et sont donc beaucoup plus stables au sein de la population. Il s’agit des fonctions biologiques remplies par les bactéries dans l’intestin. En fait, plusieurs bactéries peuvent remplir les mêmes fonctions. Ce type de calcul est très nouveau et innovant et est de plus en plus utilisé par les scientifiques dans la recherche sur la flore intestinale ces dernières années. InnerBuddies est le premier au monde à proposer également ce type de calcul dans les tests consommateurs sur la flore intestinale. Il s’agit également d’un calcul qui nécessite beaucoup de connaissances et de capacités en TIC, ce calcul prend environ 4 heures par échantillon sur de grands serveurs alors qu’un calcul sur les bactéries ne prend que 2 minutes par échantillon.

6 - Le seul fournisseur de tests de flore intestinale qui vous demande également de remplir un journal alimentaire

InnerBuddies dispose également d'une solide équipe de diététiciens. Un journal alimentaire fait partie de la panoplie d'outils/méthodes standard des diététiciens. C'est pourquoi InnerBuddies a également intégré un journal alimentaire dans sa solution. Nous demandons à tous les clients de remplir un journal alimentaire de 3 jours dans lequel ils indiquent exactement ce qu'ils ont mangé et bu au cours des 3 jours précédant le prélèvement d'échantillon de selles. Pourquoi faisons-nous cela (car il s'agit, après tout, d'une étape administrative supplémentaire dans le processus) ?

• InnerBuddies propose également une fonctionnalité permettant de fournir des conseils sur le journal alimentaire. Notre plateforme technologique fournit ici des conseils très pratiques sur chaque élément de votre journal alimentaire. Ainsi, les clients savent très clairement ce qu'ils doivent modifier dans leur régime alimentaire habituel. Après tout, de petits changements peuvent déjà avoir un impact très important. Ces conseils sont le fruit des connaissances et de l'expérience de notre équipe de diététiciens qui ont déjà mis en œuvre ce processus sur des milliers de patients et de clients.
• Toutes les données recueillies à partir du journal alimentaire sont également corrélées avec la population bactérienne que nous trouvons éventuellement dans votre propre échantillon de flore intestinale. En entraînant des modèles d'IA sur la corrélation entre tous les journaux nutritionnels complétés et les résultats de tous les comptages de bactéries/fonctions bactériennes, ce modèle d'IA sait, sur la base du big data, exactement quels ingrédients nutritionnels ont le bon impact sur quelles bactéries/fonctions bactériennes spécifiques. Cela nous permet de donner à chaque client des conseils extrêmement détaillés, basés sur les données collectives de tous nos clients.

7 - Des techniques d'IA qui vous aident à obtenir des conseils d'ingrédients très personnalisés, basés sur le big data de tous nos clients.

La plupart des publications scientifiques sur l'impact entre l'alimentation et la population bactérienne sont de nature générale (par exemple sur le suivi du régime méditerranéen ou d'un régime végétarien). Ainsi, grâce aux données de la base de données d'InnerBuddies, nous pouvons rendre les conseils beaucoup plus spécifiques, précis et transparents. Une forme de « science citoyenne » dans laquelle chaque client est ainsi non seulement aidé à un niveau individuel, mais fournit également des données grâce auxquelles le système global devient encore meilleur, plus précis et plus spécifique.

InnerBuddies est également actif dans d'autres pays où nous ajoutons des ingrédients locaux spécifiques à notre base de données, ce qui nous permet également de « surprendre » les clients avec des conseils sur des ingrédients moins connus mais qui peuvent avoir un impact important sur leur microbiome intestinal spécifique.

La plupart des gens connaissent les conseils nutritionnels généraux, qui incluent les légumes, les fruits et les fibres. Mais il existe évidemment de grandes différences dans la façon dont les différents légumes, fruits et fibres agissent. Dans le même temps, la « nutrition personnalisée » est une tendance majeure de la science. Les scientifiques ont découvert que les conseils nutritionnels personnalisés fonctionnent mieux avec les gens et sont plus efficaces que les conseils nutritionnels généraux. Cela s’explique par le fait que les gens peuvent réagir différemment à certains aliments. InnerBuddies se concentre donc sur des conseils nutritionnels très personnalisés, adaptés spécifiquement à votre situation et à votre microbiome intestinal.

8 - Notre équipe comprend un mélange de disciplines : Microbiologie/Diététiciens et experts TIC/IA

L'équipe d'InnerBuddies est unique en ce sens qu'elle combine trois disciplines différentes qui ne travaillent généralement pas beaucoup ensemble. La microbiologie concerne tout ce qui se passe dans les laboratoires. C'est la base que la plupart des prestataires de tests de la flore intestinale ont en interne. Mais InnerBuddies ajoute également des connaissances en nutrition (via des diététiciens) et en TIC (via l'intelligence artificielle).

9 - Nous sommes une spin-off de l'Université de Maastricht etnous attachons une grande importance à ce que nos conseils soient scientifiquement « corrects »

InnerBuddies n’est pas une entreprise très axée sur les « ventes et le marketing ». Nous sommes avant tout une spin-off de l’Université de Maastricht et nous pensons donc qu’il est important que tout ce que nous lançons soit scientifiquement fondé. Cela semble être une déclaration marketing très simple, mais nous avons un « professeur » dans notre équipe qui doit littéralement tout approuver avant que cela ne soit inclus dans notre plateforme. Pas seulement les résultats, mais aussi les calculs et le texte sous-jacents. Pourquoi faisons-nous cela ? Parce qu’il y a déjà suffisamment de battage médiatique et d’informations fausses dans le domaine de la santé et que nous voulons être totalement derrière notre produit.

10 - La cohorte saine InnerBuddies est basée sur des métadonnées structurées et des voies bactériennes

Chaque fournisseur de tests du microbiome intestinal utilise une forme de « cohorte saine ». Il s’agit généralement d’une base de données d’échantillons de personnes considérées comme « saines ». La cohorte saine est généralement exprimée en termes de plages minimales et maximales de bactéries spécifiques. Cette approche présente cependant deux problèmes spécifiques :

• Existe-t-il suffisamment de données pour déterminer si les gens sont réellement en bonne santé ou non ?
• La science nous a appris que les individus de différents pays ont une composition microbienne intestinale assez différente en raison d'un régime alimentaire différent. La cohorte saine est-elle donc basée sur les « Américains », les « Européens de l'Ouest » ou les « Asiatiques » par exemple ?

InnerBuddies adopte une approche différente :

• Lorsque InnerBuddies a commencé à fonctionner en tant qu'entité, nous avons « hérité » d'une cohorte saine de 450 personnes de l'Université de Maastricht. Depuis le début d'InnerBuddies, notre plateforme utilise une enquête structurée avec des questions spécifiques sur les facteurs importants pour la santé intestinale. Sur la base de cette enquête, InnerBuddies est en mesure de sélectionner clairement une cohorte saine.
• Notre cohorte saine ne repose pas uniquement sur des bactéries, mais également sur des voies bactériennes. Pourquoi le faisons-nous ? Parce que les voies bactériennes sont beaucoup plus stables au sein de la population que les compositions bactériennes. Les voies bactériennes sont des fonctions biologiques importantes, réalisées par des bactéries, qui sont principalement nécessaires à l'espèce humaine. Plusieurs bactéries différentes peuvent cependant effectuer les mêmes fonctions biologiques.