Dans la quête d’une vie plus saine, le microbiome intestinal est devenu une priorité. Nous entretenons une relation complexe avec nos microbes intestinaux. Découvrir comment les équilibrer peut être la clé d’un mode de vie plus sain. Vous avez peut-être entendu parler du microbiome humain en vous plongeant dans notre blog consacré au microbiome et vous êtes donc familiarisé avec les micro-organismes qui vivent dans votre flore intestinale. Mais saviez-vous qu’ils ont leur mot à dire sur votre santé et votre bien-être en général ? Alors que plusieurs microbes qui peuplent le microbiote intestinal sont sains et bénéfiques pour nous, certaines populations de bactéries sont associées à divers troubles de santé. Alors, quels sont les avantages et les risques des membres du microbiome intestinal ? Sont-ils liés à des bactéries uniques qui vivent dans la flore intestinale ? Certaines bactéries ont été étudiées et largement recherchées pour leurs bienfaits pour la santé (Bon) tandis que d’autres pour les troubles de santé qu’elles peuvent provoquer (Mauvais) et pour leur relation dans la production à la fois de bienfaits et de troubles de santé (Laid). Dans cet article, nous avons regroupé certaines de ces bactéries en bonnes, mauvaises ou laides.

Le bien

Les bonnes bactéries sont essentielles à notre vie. Elles remplissent de nombreuses fonctions pour la santé, comme la décomposition des aliments non digestibles et l’absorption de leurs nutriments. De plus, les bonnes bactéries rivalisent avec les pathogènes pour éviter leur colonisation dans le tube digestif tout en réduisant leur croissance et leur virulence via la production de divers métabolites, dont certaines vitamines.

Bien que la recherche ait découvert plusieurs bonnes bactéries, nous nous concentrons sur nos quatre meilleures et présentons

Bifidobactérie

Certaines souches de Bifidobacterium sont considérées comme des probiotiques importants (microbes ingérés en quantité suffisante pour avoir des effets bénéfiques sur l'hôte) et utilisées dans l'industrie alimentaire. Différentes espèces et/ou souches de bifidobactéries peuvent exercer une gamme d'effets bénéfiques sur la santé. Certains d'entre eux sont la régulation de l'homéostasie microbienne intestinale, l'inhibition des agents pathogènes et des bactéries nocives qui colonisent et/ou infectent l'intestin, la modulation des réponses immunitaires locales et systémiques, la répression des activités cancérigènes au sein du microbiome, la production de vitamines et la transformation de composés alimentaires en molécules biologiquement actives. Les bifidobactéries sont très répandues dans l'intestin du nourrisson. L'intestin du nourrisson humain est relativement stérile jusqu'à la naissance, où il absorbe les bactéries de son environnement et de sa mère. Il existe des différences dans le microbiome entre l'intestin du nourrisson et l'intestin de l'adulte. Un nourrisson atteint le stade adulte de son microbiome vers l'âge de 3 ans, lorsque la diversité de son microbiome augmente, se stabilise et que le nourrisson commence à manger des aliments solides. Bifidobacterium est la bactérie la plus commune dans le microbiome intestinal du nourrisson. Les nourrissons allaités sont colonisés plus tôt par Bifidobacterium que les bébés nourris principalement au lait artificiel. Cela est dû au fait que le lait maternel contient de fortes concentrations de lactose et de ce que l'on appelle des « oligosaccharides du lait maternel » (HMO). Les HMO sont les substrats préférés des bifidobactéries et, lors de la fermentation de ces HMO, le pH dans l'intestin du nourrisson est abaissé. Cela rend la croissance des mauvaises bactéries plus difficile.

Lactobacille

Avec Bifidobacterium, Lactobacillus est l'une des espèces les plus utilisées comme probiotiques (microbes ingérés en quantité suffisante pour avoir des effets bénéfiques sur l'hôte). Jusqu'en mars 2020, le genre Lactobacillus comprenait plus de 260 espèces différentes. Cependant, une révision de la classification du genre en 2020 a attribué les lactobacilles à 25 genres distincts. Par souci de simplicité, nous les conserverons toujours sous le genre Lactobacillus, car la plupart des bases de données scientifiques n'ont pas encore été mises à jour. Par conséquent, nous identifierons quelque chose qui estmaintenantappelé par exemple Lactiplantibacillus encore Lactobacillus.

Les espèces de Lactobacillus constituent un élément important du microbiome intestinal humain, mais habitent également plusieurs sites du corps, comme le vagin féminin. Lactobacillus présente une relation mutualiste avec le corps humain (une relation qui profite aux deux), à savoir qu'il protège l'hôte contre les invasions potentielles d'agents pathogènes, et en retour, l'hôte lui fournit une source de nutriments. Les lactobacilles font partie des probiotiques les plus courants que l'on trouve dans les aliments tels que le yaourt, mais peuvent également être achetés sous forme de comprimés, de gélules et de poudres. Il est diversifié dans son application pour maintenir le bien-être humain, car des souches spécifiques peuvent aider à traiter la diarrhée, les infections vaginales et les troubles cutanés tels que l'eczéma. Il a également été démontré que certains lactobacilles sont bénéfiques pour les troubles liés au cerveau, tels que l'anxiété et le stress. Cependant, tous ces effets dépendent de la souche, ce qui signifie que Lactobacillus n'est pas une solution miracle ; il faudrait un Lactobacillus différent pour l'eczéma que, par exemple, pour la diarrhée.

Akkermansia

Pendant longtemps, ce genre ne comprenait qu'une seule espèce connue, à savoir Akkermansia muciniphila, ce qui signifie « aime le mucus ». Pourquoi me demanderez-vous ? Eh bien, le mucus produit par l'hôte (nous) et sécrété dans le tube digestif est considéré comme le principal substrat de croissance d'Akkermansia. Le genre a été trouvé chez de nombreux mammifères et autres animaux qui produisent du mucus. Bien qu'il ne représente que 1 à 4 % des bactéries intestinales chez l'adulte, des études récentes ont indiqué qu'Akkermansia muciniphila pourrait réduire l'obésité, le diabète et l'inflammation.

Faecalibacterium

Faecalibacterium est l'une des bactéries les plus abondantes et les plus importantes du microbiome intestinal humain. Chez les adultes en bonne santé, Faecalibacterium prausnitzii (une espèce de Faecalibacterium) représente en moyenne plus de 5 % des bactéries présentes dans les intestins. Cela en fait l'une des bactéries intestinales les plus courantes, mais certaines personnes ne possèdent pas cette espèce importante. Leur rôle dans l'organisme est de renforcer notre système immunitaire. Chez les personnes ayant des niveaux inférieurs à la normale de cette bactérie dans l'intestin, cela a été associé à la maladie de Crohn, à l'obésité, à l'asthme et au trouble dépressif majeur. Une fonction bénéfique de Faecalibacterium prausnitzii est qu'il peut améliorer la fonction de barrière intestinale. En effet, il produit du butyrate, un acide gras à chaîne courte, qui est un métabolite important produit par le microbiome intestinal en fermentant les fibres alimentaires.

Le mauvais

L'écosystème intestinal est peuplé de milliards de bactéries et certaines d'entre elles sont associées à l'apparition de maladies. C'est pourquoi ces bactéries ont acquis une mauvaise réputation. Qu'il s'agisse de troubles intestinaux et digestifs ou de maladies plus complexes, les mauvaises bactéries peuvent compromettre le bien-être des personnes et mettre en péril leur santé globale.

Fusobacterium et certaines espèces de Clostridium sont les plus étudiées en raison de leurs associations avec plusieurs maladies telles que le cancer colorectal, la maladie de Crohn et les maladies cardiovasculaires.

Fusobactérie

Fusobacterium possède plusieurs espèces pathogènes (qui provoquent des maladies). La caractéristique qui rend ces espèces si efficaces est leur capacité à adhérer à une large sélection d'autres microbes dans un biofilm, ce qui leur permet de s'appuyer sur les dommages causés par ces micro-organismes. En 2011, des chercheurs ont découvert que Fusobacterium prolifère dans les cellules cancéreuses du côlon et est souvent également associé à la colite ulcéreuse.

Cela étant dit, les chercheurs n’ont pas déterminé si l’organisme est réellement à l’origine de ces maladies ou s’il se développe simplement dans l’environnement créé par ces maladies. De nombreuses études ont déjà indiqué que l’espèce Fusobacterium nucleatum (F. nucleatum) est étroitement liée à la carcinogenèse colorectale. Le cancer colorectal (CCR) est un type de cancer courant qui touche des personnes dans le monde entier. Des analyses ont montré un enrichissement de F. nucleatum dans les tissus du carcinome colorectal. Le mécanisme moléculaire a été élucidé et implique l’immunosuppression, la stimulation de la progression du cancer du côlon et la résistance aux médicaments contre le cancer.

Certaines espèces de Clostridium

Le Clostridium sensu stricto a été associé à une hypersensibilité viscérale (douleurs intestinales) chez les patients atteints du syndrome du côlon irritable. Il a également été démontré qu'il produisait du triméthylamine-N-oxyde, un métabolite de fermentation de la choline alimentaire ou de la carnitine, un métabolite lié aux maladies cardiovasculaires. En outre, il est également élevé dans la colite (inflammation de la paroi interne du côlon) et corrélé au poids corporel, ce qui pourrait jouer un rôle dans l'obésité. Le Clostridium difficile en grande quantité peut être mortel et sa présence augmente après un traitement antibiotique, car cette espèce elle-même est résistante aux antibiotiques. Habituellement, seule une transplantation fécale (FMT) peut guérir les personnes atteintes d'une « prolifération de C. difficile ».

Le laid

Certaines bactéries peuvent avoir des effets bénéfiques sur la santé, mais aussi provoquer des troubles. Ce cas intéressant entre dans la catégorie des bactéries laides.

Parmi celles-ci se trouvent certaines bactéries telles qu'Alistipes et Parabacteroides, dont on a récemment découvert qu'elles avaient une association plus établie avec la santé et la maladie.

Alistipes

Alistipes est un genre de bactérie relativement récent. Les preuves concernant son effet sur les maladies sont contradictoires. D'une part, la littérature indique qu'Alistipes pourrait avoir des effets protecteurs contre certaines maladies telles que la fibrose hépatique, la colite, l'immunothérapie contre le cancer et les maladies cardiovasculaires. D'autre part, d'autres études indiquent qu'Alistipes joue un rôle indésirable dans le développement du cancer colorectal et est associé à des signes mentaux de dépression.

Parabacteroides

Le genre Parabacteroides a été associé à des rapports d'effets bénéfiques et pathogènes sur la santé humaine. Il fait partie des nombreux genres qui produisent des lipopolysaccharides, qui provoquent une inflammation systémique s'ils traversent le tractus gastro-intestinal. Bien que Parabacteroides fasse partie du microbiome gastro-intestinal normal, il a également été associé à des maladies. Nous avons vu dans la littérature qu'il a été isolé d'infections abdominales et d'abcès chez l'homme. Plus récemment, il a été démontré que Parabacteroides avait des effets peu clairs et peu concluants sur des modèles de maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI), avec des rapports décrivant à la fois des effets pro-inflammatoires (pathogènes) et anti-inflammatoires (bénéfiques).

Connaître les bactéries qui peuplent notre flore intestinale peut nous donner un avantage important. Nous pouvons commencer à agir sur elles et favoriser la transition vers un écosystème plus favorable.

Si vous vous demandez maintenant quelles bactéries résident dans votre intestin, n'attendez plus et apprenez à connaître vos InnerBuddies dès aujourd'hui.

 

Référence

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2. Farrugia, C. (2022).Le microbiome humain : le bon, la brute et le truand. Temps de Malte.https://timesofmalta.com/articles/view/the-human-microbiome-the-good-the-bad-and-the-ugly.933538 
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