InnerBuddies neemt deel aan het Nederlandse Holomicrobiome Groeifonds Project

Het Holomicrobiome Groeifonds-project is een belangrijk initiatief van de Nederlandse overheid om microbioomonderzoek en de toepassingen ervan in verschillende sectoren te bevorderen. In maart 2024 heeft het Nederlandse kabinet € 200 miljoen uit het Nationaal Groeifonds toegewezen om een ​​publiek-privaat consortium op te richten dat zich toelegt op het bestuderen van microbiomen en hun economisch levensvatbare toepassingen.

Doelstelling van het Holomicrobioom Groeifonds Project

Het primaire doel van het Holomicrobiome Groeifonds-project is om de relaties tussen microbiomen in mensen, dieren, bodems, planten en het milieu in kaart te brengen, te analyseren en te modelleren. Door microbioomonderzoek te integreren in verschillende wetenschappelijke domeinen en bedrijfssectoren, streeft het project naar:

• Verbeteren van de gezondheid en duurzaamheid : ontwikkel innovatieve toepassingen die bijdragen aan de gezondheid van mens, dier en milieu, en aan duurzaamheid.

• Bevorderen economische groei : stimuleer economische groei door nieuwe kansen te creëren in sectoren zoals landbouw, gezondheidszorg en milieubeheer.

• Bevorderen wetenschappelijk inzicht : verdiep het inzicht in microbiomen en hun complexe interacties binnen ecosystemen.

Deelnemers aan het Holomicrobioom Groeifonds Project

Het project brengt een divers consortium van deelnemers samen, waaronder:

Academische instellingen

Er zijn tien Nederlandse universiteiten en vijf universitair medische centra bij betrokken, die hun expertise op het gebied van microbiologie, ecologie, geneeskunde en aanverwante vakgebieden inbrengen.

Het project Holomicrobiome Groeifonds is een gezamenlijk initiatief van tien Nederlandse universiteiten en vijf universitair medische centra. De deelnemende universiteiten zijn:

1. Universiteit van Amsterdam (UvA)
2. Vrije Universiteit Amsterdam (VU)
3. Radboud Universiteit (RU)
4. Rijksuniversiteit Groningen (RUG)
5. Technische Universiteit Delft (TUD)
6. Universiteit Utrecht (UU)
7. Universiteit Maastricht (UM)
8. Universiteit Twente (UT)
9. Universiteit Leiden (UL)
10. Wageningen Universiteit & Onderzoek (WUR)

De vijf betrokken universitair medische centra zijn:

1. Amsterdam UMC
2. Erasmus Medisch Centrum (Erasmus MC)
3. Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC)
4. Radboud Universitair Medisch Centrum (Radboud UMC)
5. Universitair Medisch Centrum Groningen (UMCG)

Deze instellingen werken samen om microbioomonderzoek en de toepassingen ervan in verschillende sectoren te bevorderen.

Onderzoeksorganisaties

De onderzoeksorganisaties die betrokken zijn bij het Holomicrobiome Groeifonds-project zijn onder meer:

1. Nederlands Instituut voor Ecologie (NIOO-KNAW) : Dit instituut richt zich op ecologisch onderzoek, met name de interacties tussen micro-organismen en hun omgeving.

2. KWR Water Research Institute : KWR is gespecialiseerd in watergerelateerd microbioomonderzoek, waaronder de studie van microbiomen in watersystemen en hun rol in waterkwaliteit en duurzaamheid.

3. Wageningen Research : Deze tak van Wageningen University and Research doet onderzoek naar het microbioom van planten en dieren, met een focus op landbouw en duurzaamheid.

Deze onderzoeksinstituten werken samen met academische instellingen en deelnemers uit de particuliere sector om microbioomwetenschap te onderzoeken en te verbeteren op verschillende gebieden, waaronder gezondheid, landbouw en ecologische duurzaamheid.

Partners uit de particuliere sector

Talrijke bedrijven, variërend van startups tot gevestigde ondernemingen, werken samen om onderzoeksresultaten te vertalen naar praktische toepassingen. Het Holomicrobiome Groeifonds-project brengt verschillende bedrijven uit de private sector samen die een belangrijke rol spelen bij het vertalen van onderzoeksresultaten naar toepassingen in de echte wereld. Deze bedrijven bestrijken een verscheidenheid aan sectoren, waaronder landbouw, gezondheidszorg, biotechnologie en ecologische duurzaamheid.

Enkele deelnemers uit de particuliere sector zijn:

1. DSM
2. Danone
3. Arla Foods
4. InnerBuddies
5. Genzai

Deze bedrijven dragen, samen met andere bedrijven, bij aan de commerciële ontwikkeling van nieuwe producten, diensten en oplossingen op basis van microbioomonderzoek. Dit kan een revolutie teweegbrengen in meerdere sectoren.

Overheidsinstanties

Het ministerie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit (LNV) leidt het initiatief en coördineert de inspanningen van verschillende belanghebbenden.

Verschillende overheidsinstanties zijn betrokken bij het Holomicrobiome Groeifonds -project, houden toezicht op en coördineren de implementatie ervan en zorgen ervoor dat het project aansluit bij nationale onderzoeks- en economische doelen. De belangrijkste overheidsdeelnemers zijn:

1. Ministerie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit (LNV) : Dit ministerie speelt een centrale rol in de coördinatie van het project en het afstemmen ervan op de doelen van Nederland op het gebied van duurzame landbouw, voedselkwaliteit en milieugezondheid. Het LNV investeert zwaar in het potentieel van microbioomonderzoek om landbouwpraktijken te verbeteren en duurzaamheid te bevorderen.
2. Volksgezondheid en Jeugdzorg (VWS) : Dit ministerie richt zich op initiatieven op het gebied van gezondheidszorg en volksgezondheid. Het richt zich met name op de vraag hoe microbioomwetenschap de gezondheidsresultaten kan verbeteren en kan helpen bij het aanpakken van uitdagingen zoals chronische ziekten, antibioticaresistentie en de ontwikkeling van nieuwe medische behandelingen.

Deze overheidsinstanties werken samen om strategisch toezicht, financiering en begeleiding te bieden om het succes van het Holomicrobiome Groeifonds-project te waarborgen, met de nadruk op zowel wetenschappelijke als maatschappelijke resultaten.

Wat zijn de belangrijkste onbekende onderwerpen die het Holomicrobiome Instituut wil onderzoeken?

Het Holomicrobiome Institute , dat centraal staat in het Holomicrobiome Groeifonds- project, wil een aantal belangrijke wetenschappelijke onbekenden aanpakken met betrekking tot het microbioom en de interacties ervan met menselijke, dierlijke, plantaardige en milieusystemen. Het instituut zal zich richten op het uitbreiden van kennis op gebieden die het potentieel hebben om sectoren zoals gezondheid, landbouw en duurzaamheid te transformeren. Enkele van de belangrijkste onbekende onderwerpen die het instituut wil onderzoeken, zijn:

1. Microbioominteracties in verschillende ecosystemen

Een van de belangrijkste onbekenden is hoe microbiomen in mensen, dieren, planten en het milieu met elkaar interacteren. Hoewel bekend is dat microbiomen een cruciale rol spelen in individuele ecosystemen, wordt de onderlinge verbondenheid tussen verschillende microbiomen en hun gezamenlijke impact op de gezondheid en het milieu nog steeds slecht begrepen. Belangrijke onderzoeksvragen zijn onder meer:

• Hoe communiceren en beïnvloeden microbiomen van verschillende soorten (mens, dier, plant) elkaar?
• Welke rol spelen omgevingsmicrobiomen (bodem, water, lucht) bij het ondersteunen of verstoren van andere microbiomen?

2. Microbiomen en ziektepreventie

Het potentieel van het microbioom bij het voorkomen of beheersen van ziektes is een snelgroeiend onderzoeksgebied. Er blijven echter veel vragen bestaan ​​over de precieze mechanismen waarmee microbiomen de gezondheid van mens en dier beïnvloeden. Belangrijke onbekenden op dit gebied zijn:

• Welke specifieke microbiële soorten of gemeenschapssamenstellingen beschermen tegen chronische ziekten (bijv. obesitas, diabetes, hart- en vaatziekten)?
• Hoe kunnen microbioominterventies (bijv. probiotica, prebiotica, fecale transplantaties) geoptimaliseerd worden om ziekten te behandelen of voorkomen?
• Welke rol spelen microbiomen bij het ontstaan ​​van auto-immuunziekten, allergieën en ontstekingsaandoeningen?

3. Antibioticaresistentie en microbioommodulatie

Antibioticaresistentie is een dringende wereldwijde uitdaging en microbiomen spelen een cruciale rol in de ontwikkeling en verspreiding van resistentie. Het begrijpen van hoe microbiomen bijdragen aan resistentiemechanismen en hoe ze kunnen worden gemoduleerd om resistentie te verminderen, blijft echter onduidelijk. Belangrijke onderzoeksvragen zijn:

• Hoe dragen microbiomen bij aan de ontwikkeling van antibioticaresistente ziekteverwekkers?
• Kunnen we op het microbioom gebaseerde therapieën gebruiken om antibioticaresistentie te verminderen of terug te draaien?
• Hoe kunnen microbioominterventies helpen de impact van overmatig of verkeerd gebruik van antibiotica te verminderen?

4. Microbiomen in de landbouw en duurzaamheid

Landbouw en ecologische duurzaamheid zouden enorm kunnen profiteren van een dieper begrip van microbiomen. Het instituut zal zich richten op hoe microbiomen kunnen worden ingezet om de gezondheid van de bodem, gewasopbrengsten en duurzame landbouwpraktijken te verbeteren. Belangrijke onbekenden op dit gebied zijn:

• Hoe kunnen microbiomen worden geoptimaliseerd om de plantengroei te verbeteren en de weerbaarheid van gewassen tegen plagen, ziekten en omgevingsstress te vergroten?
• Welke rol spelen bodemmicrobiomen bij koolstofvastlegging en het beperken van de effecten van klimaatverandering?
• Hoe kunnen microbiomen bij vee worden beheerd om de gezondheid, productiviteit en duurzaamheid van dieren in landbouwsystemen te verbeteren?

5. Microbiomen en milieugezondheid

De rol van microbiomen in het milieu, met name op het gebied van watersystemen, luchtkwaliteit en afvalbeheer, is nog steeds een grotendeels onontgonnen onderwerp. Het instituut wil onderzoeken hoe microbiomen interacteren met omgevingsfactoren en bijdragen aan de algehele gezondheid van ecosystemen. Enkele belangrijke vragen zijn:

• Welke invloed hebben microbiomen in natuurlijke en stedelijke omgevingen op de vervuilingsniveaus, biodiversiteit en ecosysteemdiensten?
• Welke rol spelen microbiomen bij de afbraak van verontreinigende stoffen en toxines in de bodem, het water en de lucht?
• Hoe kunnen we microbioomwetenschap gebruiken om duurzame oplossingen te ontwikkelen voor afvalbeheer en recycling van grondstoffen?

6. Gepersonaliseerde op het microbioom gebaseerde gezondheidszorg

Microbiomen variëren sterk tussen individuen, en het begrijpen van de rol van individuele microbiomen in gezondheid en ziekte is een cruciaal onderzoeksgebied. Het instituut zal onderzoeken hoe gepersonaliseerde benaderingen kunnen worden ontwikkeld op basis van microbioomprofielen om de resultaten van de gezondheidszorg te verbeteren. Belangrijke onbekenden zijn:

• Hoe kunnen we gepersonaliseerde behandelingen of interventies op basis van het microbioom ontwikkelen voor verschillende individuen of bevolkingsgroepen?
• Wat zijn de langetermijneffecten van gepersonaliseerde microbioomtherapieën op de gezondheid en hoe kunnen deze worden geoptimaliseerd?
• Hoe kunnen we veranderingen in het microbioom van een individu in de loop van de tijd monitoren en volgen, zodat we interventies effectief kunnen afstemmen?

7. Microbioom-gestuurde biotechnologie

Het potentieel van microbiomen om biotechnologische innovaties te stimuleren is enorm, maar grotendeels onbenut. Het Holomicrobiome Institute zal onderzoeken hoe microbiomen kunnen worden gebruikt bij de ontwikkeling van duurzame biotechnologieën. Dit omvat:

• Hoe kunnen microbiomen worden ingezet om duurzame biobrandstoffen, biologisch afbreekbare kunststoffen of andere waardevolle bioproducten te produceren?
• Wat zijn de mogelijke toepassingen van microbiomen in de industriële bioprocessing, zoals afvalverwerking of koolstofafvang?
• Hoe kunnen biotechnologieën die op het microbioom zijn gebaseerd, bijdragen aan circulaire economiemodellen, waarin afval wordt geminimaliseerd en grondstoffen worden hergebruikt?

8. Microbioom-gebaseerde diagnostiek

Er is een groeiende interesse in het gebruik van microbiomen als diagnostische hulpmiddelen om gezondheidstoestanden te monitoren en voorspellen. Het begrijpen van de specifieke microbiële kenmerken die geassocieerd worden met ziektes blijft echter een gebied van actief onderzoek. Het instituut zal het volgende onderzoeken:

• Kunnen microbioomprofielen worden gebruikt om ziekten te voorspellen voordat symptomen zich openbaren, zodat er eerder kan worden ingegrepen?
• Wat zijn de meest betrouwbare microbioom-biomarkers voor het diagnosticeren van specifieke ziekten of aandoeningen?
• Hoe kunnen microbioomgebaseerde diagnostiek worden geïntegreerd in de klinische praktijk voor effectievere gepersonaliseerde geneeskunde?

9. Microbiomen bij veroudering

De rol van het microbioom bij veroudering en leeftijdsgerelateerde ziekten is een snel opkomend interessegebied. Er zijn echter veel onbeantwoorde vragen over hoe microbiomen veranderen met de leeftijd en hun potentieel om verouderingsprocessen te beïnvloeden. Belangrijke onderzoeksonderwerpen zijn:

• Hoe veranderen microbiomen in de loop van iemands leven en welke invloed hebben deze veranderingen op veroudering en leeftijdsgebonden ziekten?
• Kunnen microbioominterventies helpen het verouderingsproces te vertragen of het begin van leeftijdsgerelateerde aandoeningen zoals cognitieve achteruitgang of kwetsbaarheid uit te stellen?

10. Ethiek en regelgeving omtrent het microbioom

Naarmate de microbioomwetenschap vordert, zijn er aanzienlijke ethische en regelgevende uitdagingen verbonden aan op microbioom gebaseerde therapieën en interventies. Het Holomicrobiome Institute zal ook de sociale, ethische en regelgevende implicaties van microbioomonderzoek onderzoeken:

• Welke ethische overwegingen komen voort uit het gebruik van microbiomen in de menselijke gezondheid, landbouw en milieubeheer?
• Hoe kunnen we regelgeving ontwikkelen om ervoor te zorgen dat op het microbioom gebaseerde interventies veilig, effectief en eerlijk zijn?
• Wat zijn de mogelijke risico's en onbedoelde gevolgen van het manipuleren van microbiomen, en hoe kunnen deze worden beperkt?

Samenvattend wil het Holomicrobiome Institute een breed scala aan onbekenden in de microbioomwetenschap aanpakken, van het basisbegrip van microbioominteracties in ecosystemen tot de praktische toepassing van op microbiomen gebaseerde oplossingen in gezondheid, landbouw en ecologische duurzaamheid. Door deze onbekenden te onderzoeken, wil het instituut het volledige potentieel van microbiomen voor maatschappelijk voordeel ontsluiten.

Welke rol speelt InnerBuddies in het Holomicrobiome-project?

InnerBuddies, een bedrijf dat gespecialiseerd is in gepersonaliseerde oplossingen voor darmgezondheid, is actief betrokken bij het Holomicrobiome Institute -project. Hun rol is gericht op het integreren van hun expertise in darmmicrobioomanalyse met de bredere onderzoeksdoelstellingen van het instituut.

InnerBuddies werkt ook aan een spin-off die zich richt op landbouwbodems, genaamd InnerSoils. Omdat het Holomicrobiome-programma alle soorten microbiomen omvat (inclusief het bodemmicrobioom), is daar ook een link voor InnerBuddies.